Die Finanzierung der Schule basiert auf einem Zwei-Säulen-Modell.
Während für Säule I Eltern ein Schulgeld an die evangelische Schulstiftung in Mitteldeutschland (Trägerin) zahlen, unterstützt der Förderverein über Säule II das CGJ unmittelbar.
Alle finanziellen Mittel des Fördervereins werden ausschließlich zum Nutzen des Christlichen Gymnasiums Jena und seiner Schüler eingesetzt.
Um diese direkte Finanzierung und unsere vielfältigen Aktivitäten für die Schule auch künftig gewährleisten zu können, sind wir auf neue engagierte Mitglieder und kontinuierliche Mittelzuflüsse aus Spenden und von Sponsoren angewiesen.